A Diretoria representa um nó da UJR-AmLat e é responsável pelo governo da organização. É a encarregada da gestão da UJR-AmLat, da definição dos objetivos, da missão e da visão da organização, formula os planos a curto, médio e longo prazo e é o órgão representante e de comunicação da UJR-AmLat perante o resto da sociedade.